Здание головного музея – это бывший городской зал Штадтхалле, построенный в 1912 году по проекту берлинского архитектора Рихарда Зееля. Место для постройки здания было выбрано удачно – средневековая центральная часть города рядом с Королевским замком. Замковый пруд с его многочисленными зелеными насаждениями создавал спокойную атмосферу «загорода» буквально рядом с самым оживленным районом Кенигсберга.

В поселке Чистые Пруды Нестеровского района, на холме, среди высоких вековых деревьев, стоит небольшое белое здание бывшей лютеранской кирхи и недалеко от нее - скромный пасторский дом. Здесь жил, работал и создал свои бессмертные произведения выдающийся литовский поэт XVIII века, основоположник реалистического направления в литовской литературе Кристионас Донелайтис (1714-1780).

Итак, 15 лет назад музей переезжал в новое здание Штадтхалле и не просто в новое здание, а в иную как нам казалось жизнь, в новые выставки, первой из которых была «История и культура Германии». Экспозиция по сути явилась первой серьезной попыткой взгляда на глубинную суть явлений, происходивших на этой земле. В подборе экспонатов, соединении документального и художественного рядов, в решении пространства зала был найден зримый образ среды, ставшей для многих источником духовной жизни.

Музей «Блиндаж» расположен в бывшем немецком одноэтажном железобетонном бомбоубежище, построенном в начале 1945 года. Состоит из двух монолитных блоков, строительный материал – цемент, песок, гранит, стекло. Длина убежища – 42 метра, ширина – 15 метров, глубина – 7 метров. В нем 21 помещение.